L'histoire de Champagnole a certainement débuté dans des temps très anciens, impossible à préciser.
Pour nous champagnolais, la source est liée au Mont Rivel. Champagnole est situé sur la rive droite de l'Ain et au pied du Mont Rivel (800m), elle s'étend donc dans cette vallée et elle est traversée par la route Impériale n° 5, Paris-Genève ouverte de 1760 à 1764.
De tout temps, la présence de l'Homme à Champagnole est liée aux plaines fertiles traversées par les rivières de l'Ain et de l'Angillon mais également au Mont Rivel, vaste colline dominant les voies de passage empruntant les plaines environnantes.
L'occupation humaine à Champagnole a débuté dès la préhistoire : des campements et des abris sous roches témoignent de la présence de nos lointains ancêtres sur le deuxième plateau jurassien. De nombreuses découvertes montrent également une occupation importante aux Ages des métaux. A l'époque romaine, des agglomérations secondaires (villages ou petites villes) se fondent à Equevillon, Saint-Germain en Montagne et probablement Champagnole.
Les recherches archéologiques ont montré la présence d'un sanctuaire antique sur le Mont Rivel. Au haut Moyen Age, les Burgondes puis les Francs s'installent dans la Combe d'Ain. L'archéologie funéraire à Crotenay et Monnet-la-Ville témoigne du développement du Christiannisme dès l'époque mérovingienne.
Il est probable que les destructions lors de l'envahissement des troupes barbares au milieu du 3e siècle posent des questions. Que se passe t' il pendant quelques siècles? Les auteurs divergent sur la date des premiers documents historiques, que certains situent en 1105, d'autres en 1293.
Il est probable que les historiens de l'époque ne connaissaient pas le vrai nom du lieu : Campagnola. Un document d' Adson, moine de Luxeuil, écrit au 10e siècle, intitulé "La vie de St Valbert" fait mention de ce lieu.Au cours du Moyen-Age, les sires de Commercy, Simon, époux de Nicolette de Salins, fille et héritière du plus puissant baron du lieu, va établir une dynastie sur Champagnole et les villages environnants, c'est ainsi que les Chalon-Arlay, régneront en maître sur la cité. Champagnole bénéficiera d'une chartre de franchise en 1320.
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Champagnole souffrit terriblement des batailles et des événements douloureux pendant quelques siècles : destruction en 1479 par les armées de Louis XI, en 1637 le duc de Longueville y mit le feu après avoir pris la ville et les incendies successifs eurent raison de ses constructions en bois. En 1580, tout fut détruit, en 1742, 37 maisons brûlèrent. Dans la nuit du 6 au 7 septembre 1792, incendie complet des moulins, rue du pont de l' Epée, puis le 25 avril 1798 fut le terrible incendie qui ravagea Champagnole en deux heures, 280 familles se retrouvèrent privées de tout.
De 1633 à 1636, la peste décima la population qui avait déjà été éprouvée par la lèpre jusqu'au XIIe siècle. L'incendie de 1798 fut le déclencheur de la construction du Château d'eau qui devait distribuer l'eau dans les diverses fontaines de la ville.
L'église dédiée à St Cyr et Ste Julitte, construite de 1750 à 1757 fut bénie le 16 juin 1955 et consacrée le 10 juillet 1957. C'est en 1793 que, grâce à la générosité des habitants, le retable datant des années 1600 fut acheté au couvent des Ursulines de Poligny. L' orgue vient également de Poligny du couvent des Jacobins. Ces deux monuments sont inscrits sur la liste supplémentaire des monuments historiques.
L' Ain est à l'origine des industries de Champagnole : scieries, moulins, sidérurgie.
Les forges de Champagnole ont été fondées en 1788 par la famille Muller. En 1845, ces usines s'associent pour devenir Fonderies et Forges de Franche-Comté. Actuellement seules subsistent Les Forges de Syam, fondée en 1813 par la famille Jobez, en vertu d'un décret impérial. Cette entreprise est classée monument historique.Pour plus de renseignements sur l'histoire de Champagnole, vous pouvez consulter l'ouvrage "Champagnole d' hier et
d'aujourd' hui".
Visiter le site des orgues d'Arbois : http://perso.wanadoo.fr/orgueetmusiques